RTPCR擴增目的基因cDNA需要注意的事項有哪些

2021-03-04 04:50:35 字數 710 閱讀 6326

1樓:朝顏_林西

rt-pcr 是將 rna 的反轉錄(rt)和 cdna 的聚合酶鏈式擴增(pcr)相結 合的技術。

作用從 rna 合成 cdna,再以 cdna 為模板, 擴增合成目的片段。

rt-pcr 技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞中基 因表達水平,細胞中 rna 病毒的含量和直接克隆 特定基因的 cdna 序列。

作為模板的 rna 可以是總 rna、mrna 或體外轉錄的 rna 產物。無論使用何 種 rna,關鍵是確保 rna 中無 rna 酶和基因組 dna 的汙染。

rna 的反轉錄過程遇到的問題

1. 在實驗過程中要防止 rna 的降解,保持 rna 的完整性。在總 rna 的提取 過程中,注意避免 mrna 的斷裂。

2. 為了防止非特異性擴增,必須設陰性對 照。

3. 內參的設定:主要為了用於靶 rna 的定量。常用的內參有 g**d(甘 油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-actin(β-肌動蛋白)等。

其目的在於避免 rna 定量 誤差、 加樣誤差以及各 pcr 反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成 的誤差。

4. pcr 不能進入平臺期,出現平臺效應與所擴增的目的基因的長 度、序列、二級結構以及目標 dna 起始的數量有關。故對於每一個目標序列出現 平臺效應的迴圈數, 均應通過單獨實驗來確定。

5. 防止 dna 的汙染:(1) 採用 dna 酶處理 rna 樣品。

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