我現在有了基因的cDNA序列,現在想找到這個基因的內含子序列,怎麼辦

2021-08-15 18:01:55 字數 662 閱讀 8034

1樓:匿名使用者

先做一個blast 物種選一個接近的 然後找到可能的內含子位置(不止一種) 根據這些位置在原來cdna基礎上設計引物測序 來確定內含子序列。

特殊軟體不用 在ncbi上的軟體就行

2樓:朱瑞淵

為具有與某rna鏈呈互補的鹼基序列的單鏈dna即complementary dna之縮寫,或此dna鏈與具有與之互補的鹼基序列的dna鏈所形成的dna雙鏈。與rna鏈互補的單鏈dna,以其rna為模板,在適當引物的存在下,由依賴rna的dna聚合酶(反轉錄酶)的作用而合成,並且在合成單鏈cdna後,在用鹼處理除去與其對應的rna以後,以單鏈cdna為模板,由依賴dna的dna聚合酶或依賴rna的dna聚合酶的作用合成雙鏈cdna。真核生物的信使rna或其他rna的cdna,在遺傳工程方面廣為應用。

在這種情況下,mrna的cdna,與原來基因的dna(基因組dna,genomic dna)不同而無內含子;相反地對應於在原來基因中沒有的而在mrna存在的3′末端的多a序列等的核苷序列上,與exon序列、先導序列以及後續序列等一起反映出mrna結構。cdna同樣可以被克隆。

怎樣在ncbi上查詢基因的cdna序列

3樓:布吉唧唧

使用ncbi查詢基因序列教程

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