引物是怎麼合成的,買好引物直接合成還是要設計

2025-06-07 09:05:55 字數 3853 閱讀 7893

1樓:擎科生物

目前引物合成方法採用固相亞磷醯胺法,具有高效、快速的偶聯以及判扒旦起始反應物比較穩定的特點。亞磷醯胺法是將dna固定在固相載體上完成dna鏈的合成,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的。

引物合成需藉助dna合成儀完成。dna合成儀有掘擾很多種,高通量的合成儀可單次合成上百條/千條引物。合成儀的合成原理均相同,主要差別在於合成規模、耦合此慶效率、迴圈時間及合成質量及純度的高低。

引物合成之後,還需通過氨水高溫處理,將連線在cpg上的引物切割下來,通過c18脫鹽/opc/ page/hplc等純化方式對引物進行純化,之後對成品引物進行定量、根據客戶需求進行分裝。

2樓:吳主任聊健康

1、將預先連線在固相載體上的活性基團被保護的核苷酸與三氯乙酸反應,脫去其5羥基的保護基團dmt,獲得遊離的5羥基。

2、合成dna的原料,亞磷醯胺保護核苷酸單體,與活化劑四氮唑混合,得到核苷亞磷酸活化中間體,它的3端被活化,5羥基仍然被dmt保護,與悔遊溶液中游離的5羥基發生縮合反應。

3、帶帽反碧尺銷應,縮合反應中可能有極少數5羥基沒有參加反應,用乙酸酐和甲基咪唑終止其後繼續發生反應,這種短片段可以在後續環節根據實驗需要來選擇純化方式分離掉。

4、在氧化劑碘的作用下,亞磷醯形式轉變為更穩定的磷酸困漏三酯。這樣即可合成引物。

買好引物直接合成還是要設計

3樓:深海隨便長的魚

要設計。

引物設計原則:1、引物長度:15-30bp,常用21bp左右。

2、弓|物擴增的跨度:以200-500bp為宜,(具體的長度根據實驗目的設計)。

3、g+c含量以40%-60%為宜g+c太少,擴增效果不佳,太多易出現非特指神顫異性條帶,atgc最好隨機分佈,避免5個以上的嘌呤瞎敏或嘧啶核苷酸的成串排列。

4、避免弓|物內部出現二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3』端的互補,否則會形成引物二聚體產生非特異的擴增條帶。

5、引物3』端的鹼基應該嚴格要求配對,特別是倒數第i二個鹼基,以避免因末端鹼基不配對而導致pcr失敗。

6、引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴增的靶序列最好有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子轉殖很有好處。

7、引物的特異性,引物應該與核酸序列資料庫的其他序列無明顯同源性。

8、引物量:每條引|物濃度以最低弓|物量產生唯敗所需要的結果為好,弓|物濃度偏高會弓|起錯配和非特異性擴增,且可增加弓|物形成聚體的機會。

基因工程中的引物的作用是什麼

4樓:小董懂點科技

引物(primer)森慶,又名引子。是一小段單鏈dna或rna,作為dna複製的起始點,在核酸合成反應時,作為每個多核苷酸鏈進行延伸的出發點而起作用的多核苷酸鏈。之所以需要引物是因為dna聚合酶不能從零開始合成dna,需要在一小段引物(rna或dna引物)後面啟動dna的合成。

基因工程(genetic engineering)又稱基因拼接技術和dna重組技術,是以分子遺傳學為理論基礎,以分子生物學和微生物學的現代方法為手段,將不同**的基因按預此蠢握先設計的藍圖,在體外構建雜種dna分子,然後匯入活細胞,以改變生物原有的遺傳特性、獲得新品種、生產新產品。基因工程技術為基因的檔衡結構和功能的研究提供了有力的手段。

mrna的合成需要引物嗎

5樓:網友

不需要。在轉錄過程中,dna模板被轉錄方向是從3′端向5′端拆液;rna鏈的合成方向是從5′端向3′端。rna的合成一般分兩步,第一步合成原始轉錄產物(過程包括轉錄的啟動、延伸和終止);第二步轉錄產物的後加工,使無生物活性的原始轉錄產物轉變成有生物功能的成熟rna。

但原核生物mrna的原始轉錄產物一般不需後加工就能直接作為翻譯蛋白質的模板。

rna聚合酶正確識別dna編碼鏈上的啟動子並形成由酶、dna和核苷三磷酸(ntp)構成的三元起始複合物,轉錄即自此開始。dna模板上的啟動區域常含有tataatg順序,稱普里布諾(pribnow)盒或p盒。

複合物中的核苷三磷酸一般為gtp,少數為atp,因而原始轉錄產物的5′端通常為三磷酸鳥苷(pppg)或腺苷三磷酸(pppa)。

真核dna上的轉錄啟動區域也有類似原核dna的啟動區結構,和在-30bp(即在酶和dna結合點的上游30核苷酸處,常以-30表示,bp為鹼基對的簡寫)附近也含有tata結構,稱霍格內斯(hogness)盒或 tata盒。第乙個核苷三磷酸與第二個核苷三磷酸縮合生成3′-5′磷酸二酯鍵後,則啟動階段結束,進入延伸階段。

轉錄的終止包括停止延伸及釋放rna聚合酶和合成的rna。在原核生物基因或操縱子的末端通常有一段終止序列即終止子;rna合成就在這裡終止。原核細胞轉錄終止需要一種終止因子ρ(四個亞基構成的蛋白質)的幫助。

真核生物dna上也可能有轉錄終止的訊號。

已知真核dna轉錄單元的3′端均含富有at的序列〔如aataa(a)或attaa(a)等〕,在相隔0~30bp之後又出現tttt順序(通常是3~5個t),這些結構可能與轉錄終止或者與3′端新增多聚a順序有關。

pcr技術是如何合成引物的?

6樓:關中落葉

引物你自己設計,然後發給生物公司,過幾天就合成好了。現在沒有人自己合成引物了,很麻煩,而且要求也高。

別看那些ctrl+c的人的回答了,我都服了這些人了。你回答的這麼「專業」,你合成乙個給我看看。當然,如果你是在生物公司專門合成引物的就當我沒說。

合成的引物怎麼溶解

7樓:環胤良凝安

乾粉引物。溶解稀釋方法:

收到引物後,在開啟離心管蓋前在3000-4000轉/分鐘的轉速下離心1分鐘,以防開蓋時引物乾粉散失。引物儲存在高濃度的狀況下比較穩定。如果對實驗的重複性。

要求較高,合成的od數較大,建議分裝,避免反覆凍融。引物一般配製成10-100pmol/ul(umol/l).

引物管上標有1od 相當於多少umol 的計算結果,進行稀釋時的引物加水量可以按以下公式計算:

稀釋成100pmol/ul 1od 需加水量(ul)=1od相當於umol 數×10000

例如,您拿到的引物dna合成報告單上標有1od≈ ,包裝量是1od/管,如果您希望將引物濃度定為10umol/l,那麼只需用350ul無核酸酶的雙蒸水將1od的引物乾粉溶解即可。

液體引物再稀釋可用下列公式:

稀釋引物要達到的濃度(pmol/ul)=母液濃度(pmol/ul)×汲取母液的體積(ul)÷(汲取母液的體積(ul)+加水量(ul))

引物一般來的時候是乾粉。這種狀態能儲存最長的時間。

如果用的話要先離心,5分鐘(12000轉).然後用它上面寫的nmol*1000/你的終濃度=你要加的水量。

溶解液有te和dd水。te其實就是tris鹽酸和edta的混合液。理論上用te儲存好,不容易降解。

一般配的時候要先配成儲存液(濃度是100umol/l),在配成使用液(濃度是10umol/l).這樣的好處是引物不容易降解。

引物忌諱反覆凍溶,大家要注意。如果你都配成了使用液就應該分裝。使用液放在4度(2/3個月沒問題的),儲存液放在-20度。

引物稀釋很簡單,一般裝引物的管子上都標有引物的量如,可直接往管中加360ul的無菌雙蒸水溶解就可以了,在加水之前要先高速離心管子幾分鐘,加水後要高速漩渦混勻幾分鐘就可以用了,此時的儲存濃度是10umol/l,如果體系是20ul一般加1ul引物(引物的使用濃度最大為10pmol/ul,但一般在即可 ).

引物的濃度設定,不同的人有不同習慣,有的喜歡稀釋成100um的,有的習慣於稀釋成20um,也有的稀釋成10um的。建議稀釋成20um的濃度,因為如果你稀釋成100um,當你所做pcr的體系不是很大的時候,體積太小了引物就不好加,容易產生誤差;如果是稀釋成10um,引物濃度過低,容易降解。不過不管你稀釋成多大濃度的,最好分裝儲存,免得反覆凍融容易降解。

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