如何分析差異表達基因的ma plot圖

2021-04-17 22:22:42 字數 1081 閱讀 7543

1樓:匿名使用者

差異表達基因分析是根據表型協變數(分類變數)鑑定組間差異表達,它屬於監督性分類的

回一種。在鑑定差異答表達基因以前,一般需要對錶達值實施非特異性過濾(在機器學習框架下屬於非監督性分類),因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率、甚至是功效。r分析差異表達基因的library有很多,但目前運用最廣泛的bioconductor包是limma。

鑑定差異表達基因是表達譜晶片分析pipeline中必須的分析步驟。差異表達基因分析是根據表型協變數(分類變數)鑑定組間差異表達,它屬於監督性分類的一種。在鑑定差異表達基因以前,一般需要對錶達值實施非特異性過濾(在機器學習框架下屬於非監督性分類),因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率、甚至是功效。

r分析差異表達基因的library有很多,但目前運用最廣泛的bioconductor包是limma。

如何用熒光定量pcr方法比較基因的表達的差異

2樓:南京金益柏生物科技****

如果擴增效率為1且熒光值相同的完美情況下也是可以比較的,無非就是把一個樣品中不同基因當作不同樣本中的相同基因來比較,都與這個樣品中的內參來做對比。

但麻煩的是,不同基因的擴增效率是不同的,且相同擴增效率下不同基因發出的熒光值也是不同的,所以實際情況下一般不能做比較。

基因差異表達的熱圖是什麼軟體分析的

3樓:

我不是很熟悉,簡單說兩句拋磚引玉一下。 1。左側的文字應該是基因編號,熱圖的每一行代表一個基因(或mrna?

)。 2。下方的文字應該是樣本編號,熱圖的每一列代表一個樣本。

3。上方的樹狀結構代表樣本之間的相似度聚落關係。比如從左往右,一,...

如何在折線圖上標差異顯著性

4樓:培培的觀念

你要寫p值還是打*號?

反正我們實驗室都是excel作圖,然後貼到powerpoint裡,然後再寫p值打星號啥的。

搜了一下,據說sigmaplot這個軟體可以直接加,不過我沒用過,所以也不能評價...可以試試。

如何根據RPKM值求差異表達基因

差異表達基 來因分析是根據表源型協變數 bai 分類變數 鑑定組du 間差異表達,它zhi屬於監督性分類的一dao種。在鑑定差異表達基因以前,一般需要對錶達值實施非特異性過濾 在機器學習框架下屬於非監督性分類 因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率 甚至是功效。r分析差異表達基因的lib...

在分析不同條件下細胞內基因表達差異和分析基因表達的不同可變剪接上

不同型別細胞基因表達及可變剪接的研究 肝臟是人體中最大的實質性器官,主要負責著體內脂類 糖類 蛋白質 和維生素等眾多物質的代謝,是人體中的代謝工廠。此外,肝臟在體內還發揮著解毒 免疫 儲存糖原和維生素 合成膽汁以及造血等功能,被稱之為體內最繁忙的器官。肝臟的複雜功能的發揮依賴於組成肝臟的各種型別的細...

如何進行差異基因pathway訊號通路富集分析

富集度又稱加濃度bai。富集 鈾中235u的丰度。du按zhi富集度富集鈾可分成低富集dao 低濃版 中富集權 中濃 高富集 高濃 和超富集 超高濃 鈾。各國對富集鈾的劃分標準不盡相同,根據國際原子能 iaea 規定,235u含量小於20 為低富集鈾。如何對一組基因做訊號通路分析 什麼是go富集分析...