1樓:網友
退火溫度過低會造成pcr時非特異性帶增多,如果退悄睜孫火溫度低都pcr不出結果,我覺得可能你的體系有問題,或啟鏈者引物有問題,早掘pcr溫度低只是帶比較多,一定會包含目的帶的。
2樓:網友
當然有影響,這種引物溫度差太多的都比較難擴增。
所以建議你提質粒酶切或測序。
3樓:用好五
為什麼用48℃退火呢?還有你的引物退火溫度71℃?你記錯了吧?
你把退火溫度公升到55℃。
pcr退火溫度怎麼確定?
4樓:溫嶼
計算退火溫度的方法:
1.退火溫度=4×(g+c)+2×(a+t)-(5~8) 只是粗算,有時不靈,但比較簡便。
2.用primer5(or oligo6)計算,引物配對好後,primer5可以顯示tm,我認為這個值就是退火溫度,我的經驗再加2 or 3度最好。
3.合成引物的單子上也有個tm,減去5~8也可,但有些公司提供的tm就是方法1計算的。
我認為方法二最準確,不知道還有其他方法嗎?
pcr退火溫度多少合適
5樓:禾鳥
1、退火溫度低於引物tm值5 ℃左右,一般在45~55℃。
退火溫度需要從多方面去決定,一般根據引物的tm值(tm值=4(g+c) +2(a+t))為參考,根據擴增的長度適當下調作為退火溫度。然後在此次實驗基礎上做出預估。退火溫度對pcr的特異性有較大影響。
引物延伸一般在72℃進行(taq酶最適溫度)。但在擴增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略延伸時間隨擴增片段長短而定,一般推薦在1000bp以上,含pfu及其衍生物的衍生設定為1min/kbp。
擴慧扮展資料
pcr的過程:
1、dna變性:(90℃-96℃):雙鏈dna模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈dna
2、退火:(60℃-65℃):系統溫度降低,引物與dna模板結合,形成區域性雙鏈。
3、延伸:(前啟灶70℃-75℃):在taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dntp為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的dna鏈。
pcr反應退火溫度的高低與什麼因素有關
6樓:惠企百科
退火溫度是影響pcr反應特異性的重要因素。
引物與模板復性所需要的退火溫度取決於引物的長度、鹼基組成及其濃度。引物長度越短,引物中g+c的含量越低,所需的退火溫度越低。雖然降低退火溫度可能增加擴增產量,但引物與模板間的錯配現象也會增多,導致非特異性擴增上公升。
相反,提高退火溫度雖然可以提高反應的特異性,但會引起擴增效率下降,甚至無擴增產物出現。引物的退火溫度可以通過tm=4(g+c)+2(a+t)公式組略估算,一般在算出的tm值上減去5攝氏度極為較合適反應設計退火溫度。
pcr中,退火是什麼意思
7樓:惠企百科
退火,即復性,是恢復原有性質的意思。變性的生物大分子恢復成具有生物活性的天然構象的現象。
蛋白質或核酸的天然構象,在分子遭到變性以後,全部或部分恢復。它通常是特指分子生物學中一類生物大分子物質,尤指脫氧核糖核酸(dna)和核糖核酸(rna)。
dna分子受熱變性,雙鏈分開,若再緩慢冷卻至室溫,則在260nm處吸光度降到變性前的值,這一過程稱為「退火」。經退火處理,可使變性dna的兩條多核苷酸鏈重新聚合成雙鏈螺旋結構,恢復其本來的理化性質和生物學功能。
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