瓊脂糖凝膠電泳操作應注意哪些環節

2021-04-19 20:17:48 字數 1509 閱讀 8271

1樓:匿名使用者

用瓊脂或瓊脂糖作支援介質的一種電泳方法。對於分子量較大的樣品,如大分子核酸、病毒等,一般可採用孔徑較大的瓊脂糖凝膠進行電泳分離。瓊脂糖凝膠電泳常見為題都有哪些?

dna帶模糊

dna降解:瓊脂糖凝膠電泳試驗中要避免核酸酶汙染

電泳緩衝液陳舊:電泳緩衝液多系使用後,離子強度降解,ph值上升,緩衝能力減弱,從而影響電泳實驗,建議經常更換電泳緩衝液。

所用電泳條件不合適:電泳時電壓不應超過20v/cm,溫度<30℃;巨大dna鏈電泳,溫度應該<15℃;檢車所有電泳緩衝液是否有足夠的緩衝能力

dna上揚量過多:應減少凝膠中dna上樣量。

dna樣含鹽量過高:電泳前通過乙醇沉澱去除過多的鹽。

有蛋白汙染:電泳前酚抽提去除蛋白

不規則dna帶遷移

對於λ/hindⅲ片段cos位點復性:電泳前於65℃加熱dna5分鐘,然後在冰上冷卻5分鐘。

電泳條件不合適:電泳電壓不超過20v/cm;溫度<30℃;經常更換電泳緩衝液。

dna變性:以20mm naci buffer稀釋dna,電泳前勿加熱。

帶弱或無dna帶

dna的上樣量不夠:增加dna的上樣量;聚丙烯醯胺凝膠電泳比瓊脂糖凝膠電泳靈敏度稍高,上樣量可適當降低。

dna降解:避免dan的核酸酶汙染

dna走出凝膠:縮短電泳時間,降低電壓,增強凝膠濃度。

對於eb染色的dna,所用光源不合適:應用短波長(254mm)的紫外光源

dna帶缺失

小dna帶走出凝膠:縮短電泳時間,降低電壓,增強凝膠濃度。

分子大小相近的dna帶不易分辨:增加電泳時間,核准正確的凝膠濃度。

dna變性:電泳前請勿高溫加熱nda鏈,以20mm naci buffer稀釋dna

dna鏈巨大,常規凝膠電泳不合適:在脈衝凝膠電泳上分析。

綜上所訴,瓊脂糖凝膠電泳實驗需注意以下幾點:

1.體系配製時候最關鍵的幾個試劑一定要確定它們還有效、或者還沒被汙染:引物,酶,超純水。

這些東西最好自己收好,寫上個人的名字放好,冰盒上記得帶上橡皮筋,這樣就不會因為別人翻冰箱時候把你的冰盒碰散了,試劑都碰掉。否則,你的試劑被汙染了,到時候陰性對照狂出條帶,再去找汙染源很麻煩。而且配置體系時候要注意保持實驗區的乾淨,事先可用小噴壺進行酒精噴霧,固定空氣中的dna,而且全程要戴手套,避免汙染體系。

2.pcr體系要摸準,最好用人家都做得很多的老體系來上手。

3.要想得到漂亮的電泳圖,可以在pcr開始時候就把膠倒上(前提是你的pcr總時間在1.5小時左右,並且1.

5小時候之後你還在實驗室。),讓凝膠涼著,這樣凝膠的上樣孔會比較規則,膠體裡面的其本身的孔徑也會較規則。如果你要第二天再跑膠,千萬記得把pcr完畢的樣本放入4℃儲存。

第二天做時候建議把膠涼上25分鐘左右。

4.瓊脂糖凝膠電泳上樣時候建議使用排槍上樣,不僅快速而且樣本加到膠孔裡的速度一致。當然,排槍上樣最好選用進口槍頭,國產槍頭就不要想了。

5.不管電泳室使用的頻率高還是低,我都建議每次瓊脂糖凝膠電泳時候更換電泳液,避免出現「^」形條帶。

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