illumina hiseq x ten和2019的測序資料

2021-03-27 06:28:02 字數 3905 閱讀 7480

1樓:健振韋天

不清楚這個易瑞什麼來路,目前的基因檢測主要有2類,一類是通過snp位點(基本上是以snp晶片為手段,也有針對單基因或少數幾個基因位點的使用的是pcr加測序或分型的方式),還有一類是對全基因組進行測序,一般目前採用的是hiseq x-ten測序。

**上第一種如果是幾百萬個snp位點的一般是1000元左右,如果是單基因或少數幾個基因的也就幾十塊錢。第二種全基因組測序的一般測序深度30x以上,90g左右資料,測序費用大概在8000左右,分析snp和indel的變異費用在1000左右。

但是,目前完全不建議做。因為snp的變異與疾病和表型的研究完全不夠充分。單基因的遺傳疾病根本不用測序自己就看出來了,多基因的複雜疾病基因遺傳因素所佔比例有限,只是一個相關概率問題,而且即便知道了也沒什麼手段,早點拿到的資料也是一堆atcg和snp變異和所謂風險值。

還有測序和資料分析費用在飛速下降,目前上萬的全基因組測序同樣的資料可能1年後只用幾百塊,真正有效的解讀也還要等到幾年後,沒必要花這個冤枉錢。

但是以下人群有這個切實需要:腫瘤的突變分型(目前並沒有特別靠譜的高通量測序產品,主要還是基於熒光定量pcr的檢測試劑盒),新生兒的遺傳病篩查(看個人接受程度)

高通量測序 illumina hiseq 2000 和roche454 兩種平臺的區別

2樓:土豆檸檬絲

他們復是兩家不同公司的測序制平臺

1.原理

illumina的hiseq2000和454都是通過單序列的擴增放大訊號,只是hiseq2000中間有橋式擴增,可以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。

2.資料分析和應用方向

資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。

3.通量和**

hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。

綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

求助關於illumina hiseq 2000資料分析問題

3樓:匿名使用者

illumina近日bai宣佈,其測序平臺的軟

du件有了突破性的改進,能zhi進行實時分析,並顯dao著降低了計算機執行設

內施的需求。這些軟體容改進,再加上新的genome analyzer iix,讓研究人員相對genome analyzer ii而言,測序產量能提高65%。然而,與當今資料越多,

hiseq測序和miseq測序的區別是什麼

4樓:言吾測序

通量和速度的區別(導致應用方向就不同了),其他一樣。

hiseq的測序通量遠大於miseq,而miseq的測序耗時明顯短於hiseq。

測序原理相同。

華大基因illumina-hiseq測序結果怎麼看

5樓:紫羅蘭丶花開

過長的測序週期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。

illumina測序資料檔案有多大

6樓:

illumina近日宣佈,其測序平臺的軟體有了突破性的改進,能進行實時分析,並顯著降低了計算機執行設施的需求。這些軟體改進,再加上新的genome analyzer iix,讓研究人員相對genome analyzer ii而言,測序產量能提高65%。然而,與當今資料越多,所需的計算能力也要相應提高的趨勢截然相反,illumina正通過實現儀器控制工作臺的鹼基檢出和質量評估,來簡化計算和資料處理。

illumina進一步優化了影象處理和資料分析,來支援測序產量的提高。軟體改進包括改良的簇檢測,每個流動池的讀長增加40%,更低的錯誤率。演算法優化上的突破讓標準的儀器控制檯能將實時的鹼基檢出和資料處理相整合,而無需轉移大的資料檔案,並將資料儲存的需要最小化。

最新的genome analyzer iix創新實現了資料產量和質量的顯著提高,代表了genome analyzer開發道路上一個重要的里程碑。新產品簡化了從樣品製備到資料分析的流程,增加了資料產量和質量,並擴充套件了genome analyzer的應用。

genome analyzer iix有兩個核心特徵:其一是更大的試劑冷卻器,支援超過100個測序迴圈,進一步提升了系統的易用性和自動化;其二是全新的流動池支架,讓每輪執行所得的高質量資料增加20%。依靠這些軟體和試劑的改進,genome analyzer iix現在能夠100 bp以上的配對末端讀長,並在每次執行中產生超過20 gb的高質量資料。

genome analyzer ii的使用者只需訂購genome analyzer iix upgrade kit,就能輕鬆升級到全新的系統。

illumina最新的試劑(上機測序試劑)有哪些

7樓:匿名使用者

他們是兩

抄家不同公司的測序襲平臺1.原理illumina的hiseq2000和454都是通過bai

單序du列的擴增放大訊號,只zhi是hiseq2000中間有橋式擴增,可dao以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。2.

資料分析和應用方向資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。3.

通量和**hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

illumina 有哪些測序儀

8樓:

illumina的測序

儀是bai以flowcell進行測du序的,一般的一張flowcell是一zhi個daorun,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是

一次專執行的測序量。每張flowcell上通常都有屬多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。

如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。

illumina x10和x5 的區別是什麼

9樓:

illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次運回

行的測序量。每答張flowcell上通常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。

如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。

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