1樓：匿名使用者
基因的表達分為mrna以及蛋白兩個不同的層面，你需要明確的是哪個層面的表達譜。
不管是哪個層面，你需要確定組織，根據組織的狀況確定處理/運輸/儲存組織的方法，
再次確定從組織中提取dna、rna或蛋白質的方法，最後將你的樣品（dna、rna或蛋白質）送到專業進行表達譜測定的公司進行測定，
或者你們實驗室有相關儀器，自己做也行。
給公司做，公司會負責幫你分析獲得的資料並給出最終的結果，自己做，自己分析資料獲得結果。
2樓：匿名使用者
步驟如下：
1、材料處理：對照、處理，要有生物重複；
2、取樣：按照一定的時間間隔或者固定的有最大差異的時間點取樣；通常需要嚴格區分不同組織，不能確認的樣品棄去。
3、分組織提取總rna；
4、rna質量檢測和控制；
5、測序法表達譜計數；
6、資料庫搜尋、測序計數拼接、計數和註釋；
7、不同處理結果對比
基因表達實驗流程是什麼？
3樓：匿名使用者
1、獲取目的基因
2、目的基因與載體相連
3、含有目的基因的載體匯入宿主細胞（原核或真核）4、轉錄水平的鑑定：提取total rna，可選用realtime-pcr或reverse transcription pcr鑑定
5、蛋白水平鑑定：western blot 等
基因表達譜的概述
4樓：阿k第六季
基因表達譜的獲得與表示
在基因晶片的實驗中，首先選取來自不同狀態的樣本，如正常組織與腫瘤組織、不同發育階段組織，或用藥前後的細胞或組織等。其中一種被稱為實驗樣本，另一種就是相應地被稱為參考樣本。實驗樣本和參考樣本mrna在逆轉錄過程中，分別用不同的紅、綠熒光基團標記，並將它們混合，與微陣列上的探針序列進行雜交，經過適當的洗脫步驟後，用鐳射掃描器對晶片進行掃描，獲得對應於每種熒光的熒光強度影象，通過專用的影象分析軟體，可獲得微陣列上每個點的紅、綠熒光強度（cy5和cy3），其比值（cy5/cy3）稱為該基因在實驗樣本中的表達水平。
step1：基因晶片的製備。在矽膠、玻璃片、聚丙烯或尼龍膜等載體上按特定的排列方式固定大量的探針，形成dna晶片。
晶片種類較多，製備方法也不盡相同，基本上可以分為兩大類：原位合成和直接點樣法。
step2：熒游標記探針的製備。將待分析的基因探針在晶片雜交之前進行純化、逆轉錄或擴增級熒游標記。
最普遍的熒游標記法是用cye3-dutp(綠色熒光)標記對照樣本，cye5-dutp(紅色熒光)標記實驗室樣本。
step3：標記探針與晶片雜交。選擇雜交條件，將製備的熒光探針與晶片進行雜交，一定時間以後，洗去未結合探針，然後進行熒光訊號的掃描與分析。
step4：雜交晶片的掃描。雜交後的晶片用特定波長的鐳射進行激發，此時晶片上的探針會發出不同波長的熒光。
用共聚焦鐳射掃描器檢測探針的熒光強度，可以得到cy5和cy3的兩幅單色影象。分別對這兩幅影象進行偽色彩處理，然後疊加稱為一幅影象，這就是實驗所得到的原始資料——雜交影象。影象中樣點的熒光強度值間接給出了基因晶片中對應探針的相對丰度值。
如果來自測試樣本的表達丰度高，那麼樣點呈紅色；如果來自參考細胞樣本的表達丰度高，那麼樣點呈綠色；如果兩者丰度相當，樣點就呈黃色；如果二者沒有進行雜交反應，則樣點保持背景黑色不變。通過這種方法，取自兩個不同樣本的基因相對錶達水平差異就可以表現出來。
step5：將基因表達譜資料從雜交影象中提取出來，即將原始雜交影象轉化為基因表達譜資料。
基因表達譜怎麼標準化
5樓：匿名使用者
轉錄組即某個物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的所有rna（包括mrna，**allrna及non-coding rna等）的總和。轉錄組測序是指利用第二代高通量測序技術進行cdna測序，全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態下的幾乎所有轉錄本。相對於傳統晶片而言，轉錄組測序無需預先設計探針，即可對任意物種的任意細胞型別的轉錄組進行檢測，能夠提供更精確的數字化訊號，更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍，是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。
基因表達譜指通過構建處於某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cdna文庫,大規模cdna測序,收集cdna序列片段、定性、定量分析其mrna群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度資訊，這樣編製成的資料表就稱為基因表達譜。
全基因組基因表達譜用來證明什麼
6樓：又夢駝鈴
也就是常說的數字基因表達譜，digital gene expression (dge）。它主要用來獲得差異表達基因，比如對正常植株和乾旱處理的植株進行dge分析，根據差異表達的基因我們可以鑑定到潛在的乾旱響應基因，同時對這些差異表達基因進行go註釋和kegg pathway註釋可以發現哪些通路響應了乾旱。如果實驗沒有頭緒，可以用該方法尋找思路，比如說鑑定到一些表達及其異常的基因，就可以重點關注它們，後續進行功能分析；如果前期實驗鑑定到了一些響應乾旱的基因，可以再用dge分析，如果剛好這些基因在dge分析中也差異表達，兩者也可以互相驗證。
如何利用基因表達譜資料重構網路，簡述其分析過程
7樓：迷幻
基因表達譜(gene expression profile)：指通過構建處於某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cdna文庫，大規模cdna測序,收集cdna序列片段、定性、定量分析其mrna群體組成，從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度資訊，這樣編製成的資料表就稱為基因表達譜。最大的區別是：
晶片上的探針都是固定已知的。只是用不同樣本的rna雜交然後比較差異的表達譜，晶片跟測序是兩個概念，原理就是雜交。 dge測序可以得到某一狀態下的所有轉錄本的表達譜，比晶片覆蓋的範圍要大。
有人知道 做生物學實驗 各種動物組織表達譜的個體重複數是多少嗎!!?
8樓：匿名使用者
一般就做幾個而已 畢竟做一個全基因組的表達譜就不少錢。。。。
9樓：大神餓伴您址
你是說數字表達譜測序嗎？
基因表達譜篩選出差異表達基因後，應該如何來研究差異基因的功能？
10樓：匿名使用者
你這個表達差異肯定是做了不同的處理之後吧 所以這基因的功能肯定和這個處理誘導的結果相關啊
然後就過表達或者抑制該基因的表達 在細胞水平驗證表型是否正確
11樓：我不是阿肯
採用控制變數法，可以保持其他不變，讓研究物件變化，來發現你要研究的基因的功能的不同。
基因表達譜測序怎麼與表型資訊結合
12樓：土豆檸檬絲
通常的做法如下
一般情況是表型差異的做case組和control組，一般做3個生物學重複（有一些老師為了省錢不做，現在很多雜誌的要求生物學重複，如果是新物種可以考慮不做）
分析差異基因，現在卡的閾值一般情況是 倍數為2倍，統計學檢測為p=0.05(有老師為了準確性以fdr卡統計學檢測）
對差異基因做pathway和go分析，基於訊號通路與表型聯絡起來舉個例子，棉花中抗鹽的兩組的表達譜分析，找到與抗鹽脅迫相關的訊號通路，然後找關鍵基因座q-pcr驗證，如果有實驗條件可以最關注基因做敲低表達或調高表達分析。
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