什麼叫巢式PCR,巢式PCR是什麼意思?

2022-02-21 08:49:06 字數 4262 閱讀 8085

1樓:南京金益柏生物科技****

就是多重pcr,第一次獲得產物濃度不夠,但迴圈數過多會造成產物質量不好,就會以第一次pcr產物為模板,設計內引物進行第二次擴增,獲得高質量產物

2樓:

巢式pcr是一種變異的聚合酶鏈反應(pcr),使用兩對(而非一對)pcr引物擴增完整的片段。第一對pcr引物擴增片段和普通pcr相似。第二對引物稱為巢式引物(因為他們在第一次pcr擴增片段的內部)結合在第一次pcr產物內部,使得第二次pcr擴增片段短於第一次擴增。

巢式pcr的好處在於,如果第一次擴增產生了錯誤片斷,則第二次能在錯誤片段上進行引物配對並擴增的概率極低。因此,巢式pcr的擴增非常特異。

3樓:匿名使用者

形象點兒說就像鳥巢,兩對兒引物,一對擴長片段,一對兒設計在長片段內,這樣做的好處是,提高擴增效率和特異性

4樓:百替生物

巢式pcr(nest pcr),使用兩對引物對目的基因進行擴增的一種pcr技術。首先在該基因起始密碼子上游數百bp和終止密碼子下游數百bp位置設定一對引物,這對引物由於可操控性大,可以將tm值,引物結構等設定到最佳。或者可以通過軟體自動分析,由機器給出引物序列。

然後再在目的基因的準確位置設計第二對引物。

在進行pcr時,先用第一對引物進行擴增,擴增後跑膠檢測,如果此時跑膠已經可以檢測出較好的條帶,可以進行**純化,再將**產物作為模板,用第二對引物進行第二輪擴增。如果第一輪產物跑膠時看不清楚條帶,則可以將產物適當稀釋,以此作為第二輪的模板進行擴增,一般在第一輪以低拷貝量存在的dna通過第二輪的擴增都可以成功獲得的。祝你成功。

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(生物)詳細解釋下什麼是巢式pcr

巢式pcr是什麼意思?

5樓:

巢式pcr(nested pcr),是指利用兩套pcr引物(巢式引物)對進行兩輪pcr擴增反應。

在第一輪擴增中,外引物用以產生擴增產物,此產物在在內引物的存在下進行第二輪擴增。

由於巢式pcr反應有兩次pcr擴增,從而降低了擴增多個靶位點的可能性(因為與兩套引物都互補的引物很少)增加了檢測的敏感性;又有兩對pcr引物與檢測模板的配對,增加了檢測的可靠性。

一般應用於動物方面。如:病毒,梅毒螺旋體,hiv,腫瘤基因等

標準protocol在此

此外,還引生出半巢式pcr,多重巢式pcr等等

6樓:香彥滑英華

巢式pcr是一種變異的聚合酶鏈反應(pcr),使用兩對(而非一對)pcr引物擴增完整的片段。第一對pcr引物擴增片段和普通pcr相似。第二對引物稱為巢式引物(因為他們在第一次pcr擴增片段的內部)結合在第一次pcr產物內部,使得第二次pcr擴增片段短於第一次擴增。

巢式pcr的好處在於,如果第一次擴增產生了錯誤片斷,則第二次能在錯誤片段上進行引物配對並擴增的概率極低。因此,巢式pcr的擴增非常特異。

7樓:陸河路海寧

半巢式pcr

就是巢式的一種特殊型別,巢式pcr是在完成普通pcr前提下,繼續擴增比普通pcr小的片斷,可以增加特異性,而半巢式pcr是隻換其中的一個引物,擴增比普通pcr小的片斷。通俗的說,pcr是尺子上1-4釐米,那麼巢式就是2-3釐米,半巢式就是1-3或2-4釐米,就這樣子。

8樓:敬揚圭景天

就是多重pcr,第一次獲得產物濃度不夠,但迴圈數過多會造成產物質量不好,就會以第一次pcr產物為模板,設計內引物進行第二次擴增,獲得高質量產物

9樓:庫梧永晶輝

巢式pcr(nest

pcr),使用兩對引物對目的基因進行擴增的一種pcr技術。首先在該基因起始密碼子上游數百bp和終止密碼子下游數百bp位置設定一對引物,這對引物由於可操控性大,可以將tm值,引物結構等設定到最佳。或者可以通過軟體自動分析,由機器給出引物序列。

然後再在目的基因的準確位置設計第二對引物。

在進行pcr時,先用第一對引物進行擴增,擴增後跑膠檢測,如果此時跑膠已經可以檢測出較好的條帶,可以進行**純化,再將**產物作為模板,用第二對引物進行第二輪擴增。如果第一輪產物跑膠時看不清楚條帶,則可以將產物適當稀釋,以此作為第二輪的模板進行擴增,一般在第一輪以低拷貝量存在的dna通過第二輪的擴增都可以成功獲得的。祝你成功。

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巢式pcr的原理

10樓:匿名使用者

dna的半保留複製是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈dna在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在dna聚合酶與啟動子的參與下,根據鹼基互補配對原則複製成同樣的兩分子挎貝。在實驗中發現,dna在高溫時也可以發生變性解鏈,當溫度降低後又可以復性成為雙鏈。

因此,通過溫度變化控制dna的變性和復性,並設計引物做啟動子,加入dna聚合酶、dntp就可以完成特定基因的體外複製。

但是,dna聚合酶在高溫時會失活,因此,每次迴圈都得加入新的dna聚合酶,不僅操作煩瑣,而且**昂貴,制約了pcr技術的應用和發展。

發現耐熱dna聚合同酶--taq酶對於pcr的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個迴圈加酶,使pcr技術變得非常簡捷、同時也大大降低了成本,pcr技術得以大量應用,並逐步應用於臨床。

pcr技術的基本原理 類似於dna的天然複製過程,其特異性依賴於與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。pcr由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:①模板dna的變性:

模板dna經加熱至93℃左右一定時間後,使模板dna雙鏈或經pcr擴增形成的雙鏈dna解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;②模板dna與引物的退火(復性):模板dna經加熱變性成單鏈後,溫度降至55℃左右,引物與模板dna單鏈的互補序列配對結合;③引物的延伸:dna模板--引物結合物在taqdna聚合酶的作用下,以dntp為反應原料,靶序列為模板,按鹼基配對與半保留複製原理,合成一條新的與模板dna 鏈互補的半保留複製鏈重複迴圈變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的「半保留複製鏈」,而且這種新鏈又可成為下次迴圈的模板。

每完成一個迴圈需2~4分鐘, 2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。

11樓:匿名使用者

巢式pcr(nested pcr),是指利用兩套pcr引物(巢式引物)對進行兩輪pcr擴增反應。

在第一輪擴增中,外引物用以產生擴增產物,此產物在在內引物的存在下進行第二輪擴增。

由於巢式pcr反應有兩次pcr擴增,從而降低了擴增多個靶位點的可能性(因為與兩套引物都互補的引物很少)增加了檢測的敏感性;又有兩對pcr引物與檢測模板的配對,增加了檢測的可靠性。

一般應用於動物方面。如:病毒,梅毒螺旋體,hiv,腫瘤基因等

巢式pcr,可以在10的六次方基因組背景下檢測到一個拷貝的病毒基因,也不像二次pcr容易產生成片的產物,是效果最好的pcr,但也因此是最容易汙染的pcr

巢式pcr的介紹

12樓:此生可帶

巢式pcr是一種變異的聚合酶鏈反應(pcr),使用兩對(而非一對)pcr引物擴增完整的片段。第一對pcr引物擴增片段和普通pcr相似。第二對引物稱為巢式引物(因為他們在第一次pcr擴增片段的內部)結合在第一次pcr產物內部,使得第二次pcr擴增片段短於第一次擴增。

巢式pcr的好處在於,如果第一次擴增產生了錯誤片斷,則第二次能在錯誤片段上進行引物配對並擴增的概率極低。因此,巢式pcr的擴增非常特異。

巢式pcr相對普通pcr的優缺點有哪些

13樓:匿名使用者

其優點是:

1、克服了單次擴增平臺期效應的限制,使擴增倍數提高,從而極大的提高了pcr的敏感性;

2、由於模板和引物的改變,降低了非特異性反應連續放大進行的可能性,保證了反應的特異性;

3、內側引物擴增的模板是外側引物擴增的產物,第二階段反應能否進行,也是對第一階段反應正確性的鑑定,因引可以保證整個反應的準確性及可行性。

但其亦有缺點:

進行第二次pcr墳增引起交叉汙染的機率大。為了克服此缺點,可彩用同一反應管中巢式pcr,主要利用內外引物tm值不同。

如果你已排除引物,酶,rna提取,逆轉錄等等其他原因引起的pcr不成功,確定關鍵原因是模板量低的話,可以用巢式。

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